Οι Ποντικο-περιπέτειες αφηγούνται την ιστορία 3 μικρών ποντικιών, του Χάμι Χάμστερ, του Ρόντερικ Ρατ και του Γκινέα Πιγκ, που έχουν χάσει το σπίτι τους, όταν μια δυνατή καταιγίδα τους ξέβρασε στην άγνωστη όχθη ενός ποταμού. Στην προσπάθειά τους να επιστρέψουν στον τόπο τους, θα ζήσουν μια συναρπαστική περιπέτεια γεμάτη ξεκαρδιστικές καταστάσεις αλλά και κινδύνους. Τα πράγματα θα γίνουν ακόμα πιο δύσκολα όταν ανακαλύψουν, λίγο πριν φτάσουν στον προορισμό τους, πως ολόκληρη η όχθη του ποταμού απειλείται με καταστροφή εξαιτίας της ρίψης απορριμάτων ενός εργοστασίου Βάφλας, Μαρμελάδας και Ντόνατ!